Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SERINC4A6NH21 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms