Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms