Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms