Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms