Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y9

SCN10A, Sodium channel protein type 10 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN10AQ9Y5Y9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN10AQ9Y5Y9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms