Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
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SNX13Q9Y5W8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
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SNX13Q9Y5W8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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SNX13Q9Y5W8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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SNX13Q9Y5W8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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SNX13Q9Y5W8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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SNX13Q9Y5W8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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SNX13Q9Y5W8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
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