Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4G8

RAPGEF2, Rap guanine nucleotide exchange factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF2Q9Y4G8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC33.78■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC33.78■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC33.77■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
RAPGEF2Q9Y4G8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RAPGEF2Q9Y4G8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
RAPGEF2Q9Y4G8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
RAPGEF2Q9Y4G8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
RAPGEF2Q9Y4G8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
RAPGEF2Q9Y4G8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms