Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms