Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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HCN4Q9Y3Q4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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HCN4Q9Y3Q4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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HCN4Q9Y3Q4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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HCN4Q9Y3Q4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
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HCN4Q9Y3Q4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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HCN4Q9Y3Q4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HCN4Q9Y3Q4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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