Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms