Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms