Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SBNO2Q9Y2G9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SBNO2Q9Y2G9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SBNO2Q9Y2G9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SBNO2Q9Y2G9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SBNO2Q9Y2G9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SBNO2Q9Y2G9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SBNO2Q9Y2G9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SBNO2Q9Y2G9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SBNO2Q9Y2G9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SBNO2Q9Y2G9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SBNO2Q9Y2G9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SBNO2Q9Y2G9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SBNO2Q9Y2G9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SBNO2Q9Y2G9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SBNO2Q9Y2G9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SBNO2Q9Y2G9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SBNO2Q9Y2G9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SBNO2Q9Y2G9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SBNO2Q9Y2G9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SBNO2Q9Y2G9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SBNO2Q9Y2G9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SBNO2Q9Y2G9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SBNO2Q9Y2G9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SBNO2Q9Y2G9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SBNO2Q9Y2G9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SBNO2Q9Y2G9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SBNO2Q9Y2G9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SBNO2Q9Y2G9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SBNO2Q9Y2G9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SBNO2Q9Y2G9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SBNO2Q9Y2G9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SBNO2Q9Y2G9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SBNO2Q9Y2G9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SBNO2Q9Y2G9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SBNO2Q9Y2G9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SBNO2Q9Y2G9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SBNO2Q9Y2G9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SBNO2Q9Y2G9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SBNO2Q9Y2G9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SBNO2Q9Y2G9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SBNO2Q9Y2G9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SBNO2Q9Y2G9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SBNO2Q9Y2G9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SBNO2Q9Y2G9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SBNO2Q9Y2G9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SBNO2Q9Y2G9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SBNO2Q9Y2G9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SBNO2Q9Y2G9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SBNO2Q9Y2G9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SBNO2Q9Y2G9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms