Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GNEQ9Y223 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GNEQ9Y223 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GNEQ9Y223 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GNEQ9Y223 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GNEQ9Y223 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GNEQ9Y223 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GNEQ9Y223 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GNEQ9Y223 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GNEQ9Y223 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GNEQ9Y223 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GNEQ9Y223 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GNEQ9Y223 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GNEQ9Y223 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GNEQ9Y223 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GNEQ9Y223 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GNEQ9Y223 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GNEQ9Y223 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GNEQ9Y223 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GNEQ9Y223 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GNEQ9Y223 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GNEQ9Y223 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GNEQ9Y223 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GNEQ9Y223 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GNEQ9Y223 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GNEQ9Y223 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GNEQ9Y223 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GNEQ9Y223 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GNEQ9Y223 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GNEQ9Y223 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GNEQ9Y223 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GNEQ9Y223 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GNEQ9Y223 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GNEQ9Y223 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GNEQ9Y223 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GNEQ9Y223 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GNEQ9Y223 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GNEQ9Y223 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GNEQ9Y223 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GNEQ9Y223 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GNEQ9Y223 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GNEQ9Y223 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GNEQ9Y223 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GNEQ9Y223 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GNEQ9Y223 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms