Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF9BQ9UPX0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms