Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AGTPBP1Q9UPW5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AGTPBP1Q9UPW5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AGTPBP1Q9UPW5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AGTPBP1Q9UPW5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
AGTPBP1Q9UPW5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AGTPBP1Q9UPW5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AGTPBP1Q9UPW5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGTPBP1Q9UPW5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGTPBP1Q9UPW5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGTPBP1Q9UPW5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGTPBP1Q9UPW5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGTPBP1Q9UPW5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGTPBP1Q9UPW5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGTPBP1Q9UPW5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGTPBP1Q9UPW5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
AGTPBP1Q9UPW5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGTPBP1Q9UPW5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
AGTPBP1Q9UPW5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGTPBP1Q9UPW5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
AGTPBP1Q9UPW5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGTPBP1Q9UPW5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGTPBP1Q9UPW5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGTPBP1Q9UPW5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGTPBP1Q9UPW5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGTPBP1Q9UPW5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGTPBP1Q9UPW5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGTPBP1Q9UPW5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
AGTPBP1Q9UPW5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGTPBP1Q9UPW5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
AGTPBP1Q9UPW5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGTPBP1Q9UPW5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGTPBP1Q9UPW5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGTPBP1Q9UPW5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGTPBP1Q9UPW5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGTPBP1Q9UPW5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGTPBP1Q9UPW5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGTPBP1Q9UPW5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGTPBP1Q9UPW5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms