Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
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