Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms