Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM22

EPDR1, Mammalian ependymin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPDR1Q9UM22 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPDR1Q9UM22 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EPDR1Q9UM22 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
EPDR1Q9UM22 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EPDR1Q9UM22 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EPDR1Q9UM22 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EPDR1Q9UM22 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EPDR1Q9UM22 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPDR1Q9UM22 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EPDR1Q9UM22 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPDR1Q9UM22 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPDR1Q9UM22 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPDR1Q9UM22 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPDR1Q9UM22 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPDR1Q9UM22 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPDR1Q9UM22 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPDR1Q9UM22 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPDR1Q9UM22 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPDR1Q9UM22 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPDR1Q9UM22 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EPDR1Q9UM22 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EPDR1Q9UM22 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPDR1Q9UM22 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPDR1Q9UM22 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPDR1Q9UM22 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPDR1Q9UM22 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPDR1Q9UM22 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms