Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms