Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms