Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms