Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms