Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms