Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH65

SWAP70, Switch-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWAP70Q9UH65 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SWAP70Q9UH65 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SWAP70Q9UH65 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SWAP70Q9UH65 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SWAP70Q9UH65 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SWAP70Q9UH65 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SWAP70Q9UH65 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SWAP70Q9UH65 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SWAP70Q9UH65 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SWAP70Q9UH65 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SWAP70Q9UH65 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SWAP70Q9UH65 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SWAP70Q9UH65 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SWAP70Q9UH65 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SWAP70Q9UH65 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SWAP70Q9UH65 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SWAP70Q9UH65 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SWAP70Q9UH65 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SWAP70Q9UH65 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SWAP70Q9UH65 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SWAP70Q9UH65 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SWAP70Q9UH65 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SWAP70Q9UH65 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SWAP70Q9UH65 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SWAP70Q9UH65 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SWAP70Q9UH65 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SWAP70Q9UH65 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SWAP70Q9UH65 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SWAP70Q9UH65 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SWAP70Q9UH65 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SWAP70Q9UH65 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SWAP70Q9UH65 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SWAP70Q9UH65 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SWAP70Q9UH65 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SWAP70Q9UH65 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SWAP70Q9UH65 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SWAP70Q9UH65 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms