Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms