Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBV8

PEF1, Peflin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEF1Q9UBV8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PEF1Q9UBV8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEF1Q9UBV8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEF1Q9UBV8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEF1Q9UBV8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEF1Q9UBV8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEF1Q9UBV8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEF1Q9UBV8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEF1Q9UBV8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEF1Q9UBV8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEF1Q9UBV8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEF1Q9UBV8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEF1Q9UBV8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEF1Q9UBV8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEF1Q9UBV8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEF1Q9UBV8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEF1Q9UBV8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEF1Q9UBV8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEF1Q9UBV8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEF1Q9UBV8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEF1Q9UBV8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PEF1Q9UBV8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEF1Q9UBV8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEF1Q9UBV8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEF1Q9UBV8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEF1Q9UBV8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEF1Q9UBV8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEF1Q9UBV8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEF1Q9UBV8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEF1Q9UBV8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEF1Q9UBV8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEF1Q9UBV8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEF1Q9UBV8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEF1Q9UBV8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEF1Q9UBV8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEF1Q9UBV8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEF1Q9UBV8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEF1Q9UBV8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEF1Q9UBV8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEF1Q9UBV8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEF1Q9UBV8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PEF1Q9UBV8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEF1Q9UBV8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEF1Q9UBV8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEF1Q9UBV8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEF1Q9UBV8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEF1Q9UBV8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEF1Q9UBV8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEF1Q9UBV8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEF1Q9UBV8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEF1Q9UBV8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEF1Q9UBV8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 229.1 ms