Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPASTQ9UBP0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms