Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHPF2Q9P2E5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHPF2Q9P2E5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms