Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.73■■■■■ 4.43
CCDC180Q9P1Z9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC42.73■■■■■ 4.43
CCDC180Q9P1Z9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC42.72■■■■■ 4.43
CCDC180Q9P1Z9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
CCDC180Q9P1Z9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC42.72■■■■■ 4.43
CCDC180Q9P1Z9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC42.72■■■■■ 4.43
CCDC180Q9P1Z9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
CCDC180Q9P1Z9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
CCDC180Q9P1Z9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC42.71■■■■■ 4.43
CCDC180Q9P1Z9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC42.71■■■■■ 4.43
CCDC180Q9P1Z9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC42.71■■■■■ 4.43
CCDC180Q9P1Z9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
CCDC180Q9P1Z9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
CCDC180Q9P1Z9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
CCDC180Q9P1Z9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.71■■■■■ 4.43
CCDC180Q9P1Z9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC42.71■■■■■ 4.43
CCDC180Q9P1Z9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
CCDC180Q9P1Z9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
CCDC180Q9P1Z9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
CCDC180Q9P1Z9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
CCDC180Q9P1Z9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
CCDC180Q9P1Z9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
CCDC180Q9P1Z9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
CCDC180Q9P1Z9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC42.7■■■■■ 4.43
CCDC180Q9P1Z9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC42.7■■■■■ 4.43
CCDC180Q9P1Z9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC42.7■■■■■ 4.43
CCDC180Q9P1Z9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC42.7■■■■■ 4.43
CCDC180Q9P1Z9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC42.7■■■■■ 4.43
CCDC180Q9P1Z9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC42.7■■■■■ 4.43
CCDC180Q9P1Z9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC42.69■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC42.69■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC42.69■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC42.69■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC42.69■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC42.69■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC42.69■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.69■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC42.68■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.68■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC42.68■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC42.67■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC42.67■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC42.67■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC42.66■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC42.66■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC42.66■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC42.66■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC42.66■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC42.66■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC42.65■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.65■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.65■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC42.65■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC42.65■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC42.64■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC42.64■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC42.64■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC42.64■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC42.64■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC42.63■■■■■ 4.42
CCDC180Q9P1Z9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
CCDC180Q9P1Z9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
CCDC180Q9P1Z9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC42.63■■■■■ 4.41
CCDC180Q9P1Z9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC42.63■■■■■ 4.41
CCDC180Q9P1Z9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC42.63■■■■■ 4.41
CCDC180Q9P1Z9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
CCDC180Q9P1Z9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC42.63■■■■■ 4.41
CCDC180Q9P1Z9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
CCDC180Q9P1Z9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC42.62■■■■■ 4.41
CCDC180Q9P1Z9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC42.62■■■■■ 4.41
CCDC180Q9P1Z9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC42.62■■■■■ 4.41
CCDC180Q9P1Z9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC42.62■■■■■ 4.41
CCDC180Q9P1Z9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC42.62■■■■■ 4.41
CCDC180Q9P1Z9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC42.62■■■■■ 4.41
CCDC180Q9P1Z9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
CCDC180Q9P1Z9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
CCDC180Q9P1Z9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
CCDC180Q9P1Z9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC42.61■■■■■ 4.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms