Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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