Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
C9orf78Q9NZ63 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
C9orf78Q9NZ63 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
C9orf78Q9NZ63 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
C9orf78Q9NZ63 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
C9orf78Q9NZ63 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
C9orf78Q9NZ63 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C9orf78Q9NZ63 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C9orf78Q9NZ63 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
C9orf78Q9NZ63 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C9orf78Q9NZ63 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C9orf78Q9NZ63 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C9orf78Q9NZ63 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C9orf78Q9NZ63 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C9orf78Q9NZ63 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C9orf78Q9NZ63 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C9orf78Q9NZ63 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C9orf78Q9NZ63 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C9orf78Q9NZ63 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C9orf78Q9NZ63 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C9orf78Q9NZ63 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
C9orf78Q9NZ63 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C9orf78Q9NZ63 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C9orf78Q9NZ63 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C9orf78Q9NZ63 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C9orf78Q9NZ63 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C9orf78Q9NZ63 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C9orf78Q9NZ63 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C9orf78Q9NZ63 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C9orf78Q9NZ63 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
C9orf78Q9NZ63 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C9orf78Q9NZ63 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C9orf78Q9NZ63 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
C9orf78Q9NZ63 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C9orf78Q9NZ63 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C9orf78Q9NZ63 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C9orf78Q9NZ63 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C9orf78Q9NZ63 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C9orf78Q9NZ63 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C9orf78Q9NZ63 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C9orf78Q9NZ63 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C9orf78Q9NZ63 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C9orf78Q9NZ63 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C9orf78Q9NZ63 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C9orf78Q9NZ63 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C9orf78Q9NZ63 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C9orf78Q9NZ63 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C9orf78Q9NZ63 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C9orf78Q9NZ63 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C9orf78Q9NZ63 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
C9orf78Q9NZ63 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
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