Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYB5

SLCO1C1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1C1Q9NYB5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLCO1C1Q9NYB5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLCO1C1Q9NYB5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLCO1C1Q9NYB5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLCO1C1Q9NYB5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLCO1C1Q9NYB5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLCO1C1Q9NYB5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLCO1C1Q9NYB5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLCO1C1Q9NYB5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLCO1C1Q9NYB5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLCO1C1Q9NYB5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLCO1C1Q9NYB5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLCO1C1Q9NYB5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLCO1C1Q9NYB5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLCO1C1Q9NYB5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SLCO1C1Q9NYB5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLCO1C1Q9NYB5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLCO1C1Q9NYB5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SLCO1C1Q9NYB5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLCO1C1Q9NYB5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLCO1C1Q9NYB5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLCO1C1Q9NYB5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLCO1C1Q9NYB5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLCO1C1Q9NYB5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLCO1C1Q9NYB5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLCO1C1Q9NYB5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLCO1C1Q9NYB5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLCO1C1Q9NYB5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLCO1C1Q9NYB5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms