Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY59

SMPD3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD3Q9NY59 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms