Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM9Q9NXL9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MCM9Q9NXL9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms