Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms