Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASF1BQ9NVP2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms