Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMC4Q9NTJ3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms