Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EMILIN3Q9NT22 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EMILIN3Q9NT22 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms