Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms