Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMPRSS4Q9NRS4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms