Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ3

CCL28, C-C motif chemokine 28, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28Q9NRJ3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCL28Q9NRJ3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCL28Q9NRJ3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCL28Q9NRJ3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCL28Q9NRJ3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CCL28Q9NRJ3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCL28Q9NRJ3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CCL28Q9NRJ3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms