Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGEF4Q9NR80 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARHGEF4Q9NR80 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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