Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX1

PRDM5, PR domain zinc finger protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM5Q9NQX1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM5Q9NQX1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM5Q9NQX1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM5Q9NQX1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM5Q9NQX1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM5Q9NQX1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM5Q9NQX1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM5Q9NQX1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM5Q9NQX1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM5Q9NQX1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM5Q9NQX1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM5Q9NQX1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM5Q9NQX1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM5Q9NQX1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM5Q9NQX1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM5Q9NQX1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM5Q9NQX1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM5Q9NQX1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM5Q9NQX1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM5Q9NQX1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM5Q9NQX1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM5Q9NQX1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM5Q9NQX1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM5Q9NQX1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM5Q9NQX1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM5Q9NQX1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM5Q9NQX1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM5Q9NQX1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM5Q9NQX1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM5Q9NQX1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM5Q9NQX1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM5Q9NQX1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM5Q9NQX1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM5Q9NQX1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM5Q9NQX1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM5Q9NQX1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM5Q9NQX1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM5Q9NQX1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM5Q9NQX1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM5Q9NQX1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM5Q9NQX1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM5Q9NQX1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM5Q9NQX1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM5Q9NQX1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM5Q9NQX1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM5Q9NQX1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms