Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR4

NIT2, Omega-amidase NIT2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIT2Q9NQR4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms