Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ6

MED4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED4Q9NPJ6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED4Q9NPJ6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms