Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC8

SIX2, Homeobox protein SIX2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX2Q9NPC8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIX2Q9NPC8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms