Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB3

CABP2, Calcium-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP2Q9NPB3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms