Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB6Q9NP58 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB6Q9NP58 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB6Q9NP58 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB6Q9NP58 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB6Q9NP58 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCB6Q9NP58 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms