Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN3

TMEM8A, Post-GPI attachment to proteins factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM8AQ9HCN3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms