Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKRIP1Q9H875 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms